提供以10cm 培养皿为单位的多种SILAC标记类型的HEK-293T细胞沉淀,细胞数目为1~2×107 细胞/10cm 皿,能够提取的蛋白质总量为2~3mg (经验值)。该细胞沉淀可作为基于SILAC质谱定量的“内标”。
细胞沉淀可为用户的使用/应用提供更多的灵活性和选择性。如匹配用户的蛋白质提取和质谱前处理方式,保障实验体系的统一性和一致性。
HEK-293T细胞蛋白质组质谱鉴定及相对丰度 (iBAQ) 数据:
使用“MG13:细胞/组织差异蛋白质组样本制备试剂盒”对K0R0-293T细胞进行蛋白质提取、蛋白质酶解、肽段提取及肽段除盐。
对除盐肽段进行质谱检测,质谱参数:(1)液相:NanoElute,(2)Tims-TOF Pro,(3)1小时质谱测试时间。DDA-PASEF数据采集模式。(3)肽段上样量:200ng。
数据检索:Maxquant (2.6.1.0),默认检索参数。
共鉴定到5242种蛋白质。表中的iBAQ值可衡量这些蛋白质在HEK-293T细胞中的相对表达丰度。