Proteograph—DEMO数据下载
ProteographTM血浆蛋白质组高深度分析系统结合质谱，解决了传统技术流程对血浆蛋白质组解析的技术瓶颈（无法平衡样品通量、解析深度和宽度），为疾病相关血浆蛋白质分子标志物的筛选和发现提供了全新的技术解决方案，开启了血浆蛋白质分子标志物探索的新篇章。
本DEMO数据是利用ProteographTM系统结合质谱系统完成了对6例“真实”血浆样本的探索性研究分析，总体结果汇总如下：
| 类别 | 说明/参数 | 备注 |
| 样本类型 | 血浆，共6例 | 3例对照（Group H）， 3例疾病（Group D） |
| ProteographTM样品制备 | 制备时间：~7小时；共获得6*5=30个肽段样品 | 每例样本分别与5种磁珠 (5 NPs) 孵育。 |
| 质谱类型 | TimsTOF Pro，DIA-PASEF模式 | / |
| 质谱测试时间 | 44min/针，共计测试时间：22小时 (44min*30=1320min) | / |
| 蛋白质鉴定总数 | 5144种 | / |
| 鉴定蛋白质的动态分布范围 | >9个数量级 （>9log） | / |
| 筛选的差异表达蛋白 (DEPs) 数目 | 60种 | / |
本DEMO数据提供了（1）完整的蛋白质鉴定列表，（2）完整的肽段鉴定列表，（3）实验流程和对实验结果的分析和探讨。
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ProteographTM-DEMO数据及分析下载
*血浆标准品ProteographTM稳定性测试*
标准品信息：
[该标准品为冻干粉，实验表明其蛋白质鉴定数目要比血浆溶液少很多，但并不影响鉴定的覆盖深度！该标准品是作为Proteograph实验的监控对照（Processing Control），用于监控实验的整体流程是否稳定、正常。其蛋白质鉴定数目不用于对“真实”样品的对照与参考]
| 类别 | 说明/参数 | 备注 |
| 样本类型 | 血浆标准品（Plasma standard）：3例（P1~P3） | 该标准品为血浆冻干粉，复溶后上机（SP100）测试。 |
| ProteographTM样品制备 | 制备时间：~7小时；共获得3*5=15个肽段样品 | 每例样本分别与5种磁珠 (5 NPs) 孵育。 |
| 质谱类型 | TimsTOF Pro，DIA-PASEF模式 | / |
| 质谱测试时间 | 44min/针，共计测试时间：11小时 (44min*15=660min) | / |
数据分析汇总：
A. 3例标准品（P1~P3），按NP（NP1~NP5）统计的蛋白质鉴定总数（Total）及重合鉴定的蛋白质数目（Overlap），重合鉴定蛋白质比例均超过94%。
B-C. 按样本统计的蛋白质鉴定数目（P1~P3）、重合鉴定的蛋白质数目（Overlap）和鉴定总数（Total），3例样本重合鉴定比例为93.8% (C)。
D. 样品Pearson相关系数（>=0.97)分析（基于蛋白质LFQ intensity定量值），提示样品高度同质。
E. 按NP和总体（Across 5 NPs）统计蛋白质定量CV分布（基于蛋白质LFQ intensity定量值），总体CV%约为10%（质谱系统层面）。
F. 鉴定蛋白质的动态分布范围分析。与HPPP数据库（https://peptideatlas.org/builds/human/plasma/）匹配到了1140种蛋白质（HPPP-matched），蛋白质动态分布范围>9个数量级。另有332种是Proteograph系统鉴定到的“新”血浆蛋白（Proteograph-exclusive）。
*该数据显示了Proteograph系统优异的稳定性、重现性和高效性*