蛋白质-蛋白质互作—质谱分析

  • IP-MS(Immunoprecipitation-Mass Spectrometry)是目前主流的进行蛋白质相互作用/ 后修饰高通量筛选的技术方案。即将免疫沉淀(Immunoprecipitation)介导的蛋白质互作复合物富集和质谱检测结合,实现对靶标互作蛋白的鉴定与筛选。

  • SILAC-IP-MS:是将SILAC (Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture) 细胞标记和IP-MS 结合,利用SILAC 标记在细胞蛋白质上引入的质量标签(masstag),借助质谱实现对蛋白质的相对定量,去除非特异性蛋白,快速锁定特异性互作蛋白,极大地提高后续IP-WB 验证的阳性成功率。

  • 与SILAC-IP-MS 相比,IP-MS 只能定性,无法从背景蛋白中区分特异性相互作用。因此,客户选择IP-MS方案,后续的潜在互作蛋白须自行筛选。


*谱璟科技SILAC-IP-MS技术平台*

  • 技术流程:

SILAC_IP-MS流程图


  • 谱璟科技服务流程及质控标准:

SILAC_IP-MS服务流程


  • SILAC-IP-MS技术应用场景及特点:

SILAC-IP-MS2


  • 服务咨询及注意事项:

  1. 普通的IP-MS无法获得定量信息,如客户选择该方案,潜在的候选互作蛋白须自行挑选。

  2. 如需了解更多信息,可预约进行在线数据分享交流。预约请发送邮件至:market@imultiomics.com。


  • 产品链接:

  1. SILAC培养基Kit

  2. SILAC标记293T细胞系

  3. anti-FLAG tag IP/Co-IP试剂盒

  4. Co-IP试剂盒(质谱级)


  • 项目DEMO数据及分析:

SILAC-IP-MS-实验数据


SILAC-IP-MS_数据分析


  • 成功案例:

  1. Batool A, Liu H, Liu Y-X, Chen S-R: CD83, a Novel MAPK Signaling Pathway Interactor, Determines Ovarian Cancer Cell FateCancers 2020, 12(8):2269.

  2. Gao Y, Liu S, Guo Q, Zhang S, Zhao Y, Wang H, Li T, Gong Y, Wang Y, Zhang T et alIncreased expression of TRIP13 drives the tumorigenesis of bladder cancer in association with the EGFR signaling pathwayInternational Journal of Biological Sciences 2019, 15(7):1488-1499.

  3. Yu W, Tang L, Lin F, Yao Y, Shen Z: DGKZ Acts as a Potential Oncogene in Osteosarcoma Proliferation Through Its Possible Interaction With ERK1/2 and MYC PathwayFrontiers in Oncology 2019, 8(655).

  4. Zhang X, Gao D, Fang K, Guo Z, Li L: Med19 is targeted by miR-101–3p/miR-422a and promotes breast cancer progression by regulating the EGFR/MEK/ERK signaling pathwayCancer Letters 2019, 444:105-115.

  5. Sun Y, Bao Q, Xuan B, Xu W, Pan D, Li Q, Qian Z, Jung JU: Human Cytomegalovirus Protein pUL38 Prevents Premature Cell Death by Binding to Ubiquitin-Specific Protease 24 and Regulating Iron MetabolismJournal of Virology 2018, 92(13):e00191-00118.

  6. Sun T, Du W, Xiong H, Yu Y, Weng Y, Ren L, Zhao H, Wang Y, Chen Y, Xu J et alTMEFF2 Deregulation Contributes to Gastric Carcinogenesis and Indicates Poor Survival OutcomeClinical Cancer Research 2014, 20(17):4689-4704.



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