m6A修饰质谱定量分析

  • 目前已知在细胞的RNA 分子上有超过100 种不同的化学修饰。在mRNA(编码蛋白质的基因)分子中,腺嘌呤核苷(Adenosine,A)嘌呤碱基的N6 甲基化(N6-Methyladenosine,m6A)是mRNA 分子中丰度最高的修饰。

  • m6A 的动态修饰变化参与调控众多生理过程,并与肿瘤发生/ 发展相关联(Cell 2017, 169, 1187-1200;Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2017, 15, 154-16)。

  • 除了m6A-seq 和MeRIP-seq 等(Frontiers in Immunology 2019, 10, 922)能比较分析样本之间总的m6A 水平的差异变化,利用质谱(MS)可实现对多样本之间的m6A 水平的相对和绝对定量是m6A 修饰研究必不可少的数据,是对m6A-seq 和MeRIP-seq 等实验方法的有力补充。

  • 质谱检测样本中总m6A 水平是基于MRM(Multiple Reaction Monitoring)技术原理进行的,即利用核苷分子在质谱上获得的前体离子/ 碎片离子对(Precursor/product ion pair)信息,实现对核苷的定性和定量分析,比如m6A在质谱上其Precursor/product ion pair 为282.1Da/150.1Da。


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